나노기술 및 정책 정보

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● Fangqing Zhao 연구원(중국과학원 동물연구소) 연구팀은 전체 전사체 캡처 기술과 컴퓨터 프로그래밍 실시간 제어 알고리즘을 결합해 시퀀싱 과정에서 분석과 농축을 동시에 수행할 수 있는 전체 전사체 프로그래밍 가능 지능형 시퀀싱 신기술(PROFIT-seq)을 개발

● 연구팀이 개발한 전체 전사체 프로그래밍 가능 지능형 시퀀싱 신기술(PROFIT-seq)은 혁신적인 복합 역전사 전략과 롤링 서클 증폭(RCA) 기술을 통해 폴리아데닐화(polyadenylated), 비폴리아데닐화(non-polyadenylated), 환형 RNA(circular RNA) 등 다양한 유형의 전사체를 포획할 수 있고, 시퀀싱 과정에서 실시간 제어가 가능하며, 필요에 따라 표적 전사체를 선택적으로 농축 가능

● 연구팀은 기댓값 최대화(Expectation-Maximization, EM) 알고리즘을 기반으로 전체 전사체 지능형 정량 모델을 설계하고, 표적 전사체의 전장 시퀀스와 비표적 분자의 단시간 시퀀싱 태그를 결합해 정밀한 전체 전사체 정량 분석을 실현

● 연구팀이 개발한 신기술은 표적 전사체의 정밀한 단분자 검출과 전체 전사체의 비편향 정량화(Unbiased Quantification)가 가능해 생명과학 연구, 병원체 검출 및 임상 진단 등의 분야에 광범위하게 활용할 수 있을 것으로 기대

Nature cell biology (2024.10.23.) Real-time and programmable transcriptome sequencing with PROFIT-seq